Esta colección deriva de varios proyectos de CONABIO en colaboración con la Dra. María Esther Meave del Castillo †, concluidos con satisfacción total. Entre ellos se incluyen “Diatomeas Planctónicas del Océano Pacífico de México” (Proyecto H176), “Diatomeas Planctónicas Marinas del Pacífico Tropical Mexicano” (Proyecto S151), “Diatomeas (Bacillariophyceae), Dinoflageladas (Dinophyceae) y Silicoflagelados (Dictyochophyceae) marinos del Pacífico mexicano con énfasis en la porción tropical” (Proyecto BA008), "Dinoflagelados y Diatomeas del Pacífico tropical mexicano" (Proyecto DJ022), "Diversidad y dinámica del fitoplancton marino en la bahía de Acapulco, Guerrero" (Proyecto HJ014) y “Catálogos de autoridades taxonómicas de diatomeas planctónicas y ticoplanctónicas (Bacillariophyta) y dinoflagelados (Dinophyta) de mares mexicanos” (Proyecto KT020).
Además, la colección se ha enriquecido mediante varias campañas oceanográficas en las que participó la M. en C. María Eugenia Zamudio Reséndiz a bordo del B/O "Justo Sierra" (SGM2005, SGM2006, SGM2008, SGM2010). Instituciones externas, como la UNAM y la UV, también han contribuido con depósitos de muestras dentro de la colección.
A lo largo de 25 años, la colección ha crecido hasta contar con 4,256 muestras. De estas, 2,499 son muestras líquidas fijadas y 1,757 están montadas en laminillas, representando un total de 142,596 organismos fitoplanctónicos, principalmente diatomeas y dinoflagelados, todos identificados y catalogados a nivel de especie. La identificación y categorización de los organismos se realizó principalmente en estos dos grupos, empleando claves taxonómicas específicas y, en algunos casos, técnicas de biología molecular para la caracterización taxonómica.
Los procesos de curación se realizan con altos estándares de calidad, y la colección integra cultivos fijados y datos detallados que abarcan aspectos físicos, localidad, método de colecta (red, botella, cultivo), profundidad y fecha. Esta base de datos representa una herramienta invaluable para investigaciones taxonómicas, estudios de abundancia y biodiversidad, y apoyo a la comunidad científica interesada en las algas y protistas.