El hidrobiólogo podrá desempeñarse profesionalmente:

• En dependencias del sector público relacionadas con la protección al ambiente y el aprovechamiento y manejo de los recursos naturales acuáticos, en los ámbitos de la ecología, la pesca y la acuicultura.
• En el sector privado, en consultorías ambientales y empresas de producción.
• En el sector académico, dedicado a la investigación y la docencia en distintos niveles de educación media y superior.